AfterEffectsを最新バージョンと旧バージョンが混在する場合に困るのは旧バージョンに持って行った時にプロジェクトファイルが開けないことです。最新のCC2020では旧バージョンの書き出しが可能です。
プロジェクトファイルを「別名で保存する」で保存してください。
気をつけたいのが、バージョンとAfterEffectsno名称がわかりにくいところです。
AfterEffects CC2020 バージョン17.xx
AfterEffects CC2019 バージョン16.xx
AfterEffects CC2018 バージョン15.xx